Bonjour,
Merci pour vos réponses. Le problème est résolu et nous avons 2
approches pour le faire. C'est plus sûr. 
En réalité j'ai oublié un détail : le résultat final attendu suppose une
étape supplémentaire car il faut regrouper tous les fichiers csv
produits en un seul en les concaténant.
Autre détail qui n'est effectivement pas sans importance : notre
doctorante travaille sous Linux et n'a pas MS-Excel sur son poste de
travail.
- méthode 1 : utiliser xls2csv de façon à conserver proprement les
heures, utiliser un script shell à base de awk et sed pour séparer les
onglets et corriger les dates (toujours les mêmes dans un même onglet) à
partir du nom de fichier, concaténer les fichiers tout en procédant à un
petit nettoyage : shell avec cat et sed.
- methode 2 : utiliser batchconv modifié par Laurent Godard pour
extraire l'onglet voulu de tous les fichiers xls du répertoire.
Concaténer les fichiers csv obtenus comme avec la méthode 1.
La méthode 1 fonctionne presque parfaitement (des erreurs de nettoyage)
mais en 2 bonnes heures.
La partie batchconv de la méthode 2 fonctionne parfaitement. Je ne l'ai
pas encore testée sur les 2800 fichiers xls. Il me reste à bien
comprendre la macro que m'a fournie Laurent, à isoler le script de
concaténation et à faire un test en vrai grandeur.
Avant de l'appliquer à un autre stock de fichiers encore plus volumineux 
Je mettrai le code ici dés que je l'aurai compris.
Mais toutes les
infos nécessaires sont expliquées dans le bouquin de Laurent et Bernard
(Programmation OpenOffice.org et LibreOffice chez Eyrolles).
Cela pourrait peut-être donner une nouvelle version étendue de batchconv
avec cette option du choix de l'onglet à extraire lors de l'export en csv.
Bonne journée
JBF